Pêches et Océans Canada est composé d'une administration centrale nationale, située à Ottawa, et de six régions s'étendant d'un océan à l'autre.
L'honorable Keith Ashfield est le ministre des Pêches et des Océans.
Le sous-ministre Matthew King relève directement du ministre.
Le sous-ministre délégué, le Commissaire de la Garde côtière canadienne et les autres membres du Conseil de gestion du Ministère, dont les directeurs généraux régionaux et les chefs de secteur à l'administration centrale nationale, relèvent directement du sous-ministre des Pêches et des Océans.
L'organigramme ci-dessous illustre la structure organisationnelle.
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Ministre des Pêches et des Océans
Sous-ministre
Sous-ministre délégué
Directeurs généraux régionaux
DGR, Centre et Arctique
DGR, Golfe
DGR, Maritimes
DGR, Terre-Neuve-et-Labrador
DGR, Pacifique
DGR, Québec
Chefs des secteurs
SMA, Gestion des écosystèmes et des pêches
SMA Transformation
SMA, Ressources humaines et Services intégrés
Dirigeant principal des finances
SMA, Politiques stratégiques
SMA, Programmes
SMA, Sciences des écosystèmes et des océans
Dirigeant principal de la vérification
DG, Communications
Avocat général principal
Directrice exécutive, Valeurs, intégrité et résolution de conflits
Commissaire, Garde côtière canadienne
Sous-commissaire, Opérations
Sous-commissaire, Acquisition des navires
Commissaires adjoints
CA, Centre et Arctique
CA, Ouest
CA, Atlantique
Directeurs généraux
DG, Opérations
DG, Services techniques intégrés
DG, Exigences des programmes
DG, Services de gestion intégrée des affaires
DG, Grands projets
SMA = Sous-ministre adjoint
DGR = Directeur général régional
CA = Commissaire adjoint
DG = Directeur
général