Avis scientifique 2020/058

Avis sur l'utilisation des analyses ciblées d’ADN environnemental (ADNe) pour la gestion des espèces aquatiques envahissantes et des espèces en péril

Sommaire

• Dans le présent document, l’ADN environnemental (ADNe) désigne l’ADN extrait d’échantillons environnementaux (p. ex. eau, biofilms, air, sédiments, contenu du tube digestif, matières fécales) et analysé aux fins de suivi et de surveillance biologiques. Le présent avis est axé sur des approches en matière d’ADNe cible qui permettent de détecter de façon sélective l’ADN d’organismes aquatiques qui présentent un intérêt du point de vue de la gestion. Étant donné que la PCR quantitative (qPCR) est actuellement l’approche d’ADNe cible la plus courante et la plus largement utilisée, elle sera au cœur même du présent avis.
• Lorsque les méthodes d’analyse de l’ADNe cible sont adéquatement validées, elles peuvent être utilisées pour déduire indirectement la présence ou l’absence d’organismes cibles. Pêches et Océans Canada (MPO) et les clients du MPO utilisent de plus en plus des approches fondées sur l’ADNe pour la surveillance des programmes et la prise de décisions.
• Le présent avis constitue un premier pas vers une communication cohérente et transparente entre les utilisateurs finaux de l’ADNe et les fournisseurs de services (p. ex. la Direction des sciences du MPO ou une tierce partie), de même que vers la production de rapports à cet égard. Le présent avis vise à favoriser l’élaboration de normes et de consensus nationaux et internationaux en matière de rapports.
• Les nombreuses forces des approches en matière d’ADNe (p. ex. non destructives, non intrusives, sensibles) en font un outil de gestion idéal pour la détection et la surveillance d’organismes qui sont souvent difficiles à détecter au moyen de méthodes conventionnelles de surveillance, comme les espèces aquatiques envahissantes et les espèces en péril.
• Le présent avis comprend un document d’orientation sur l’ADNe et un modèle de rapport. Sans être trop normatifs, ils peuvent servir d’outils complémentaires pour appuyer le bien-fondé des décisions basées sur la science et accroître la confiance dans les études sur l’ADNe, car ils fournissent l’information nécessaire pour que les gestionnaires comprennent bien la conception, la mise en œuvre et l’interprétation des études sur l’ADNe.
• La validité des données et des résultats relatifs à l’ADNe repose sur un plan d’étude rigoureux, qui est propre aux objectifs du projet et qui est le plus efficace lorsqu’il est élaboré tôt dans le processus et en consultation avec les gestionnaires et les utilisateurs finaux, les écologistes ou les chercheurs, et les fournisseurs de services d’ADNe. Le plan d’étude devrait comprendre un échantillonnage sur le terrain suffisant et approprié sur le plan écologique pour les organismes cibles, la prévention de la contamination, et l’utilisation appropriée des mesures de contrôle sur le terrain et en laboratoire pour vérifier les erreurs potentielles.
• Pour assurer l’uniformité des rapports et l’interprétation appropriée des données, le document d’orientation comprend une échelle de validation de l’ADNe aux fins d’évaluation de la rigueur des tests d’ADNe et un exemple d’arbre décisionnel pour la détection de l’ADNe en vue de faciliter l’interprétation des résultats de la qPCR.
• Les résultats de l’ADNe doivent être interprétés dans le contexte des objectifs de gestion et de la tolérance au risque. Les critères d’interprétation doivent être choisis en consultation avec les gestionnaires et les utilisateurs finaux des ressources, les spécialistes de l’ADNe, les écologistes et d’autres experts dans le domaine, et en tenant compte des facteurs environnementaux pertinents.

Le présent avis scientifique découle de la réunion nationale d’examen par les pairs du 6 au 8 juillet 2020 sur les Lignes directrices pour l’utilisation ciblée des analyses d’ADN environnemental (ADNe) pour la gestion des espèces aquatiques envahissantes et des espèces en péril. Toute autre publication découlant de cette réunion sera publiée, lorsqu’elle sera disponible, sur le calendrier des avis scientifiques de Pêches et Océans Canada.

Avis scientifique 2020/058 (PDF, 990 ko)

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