Séquençage de l'étiquette de séquence exprimée et développement d'outils génomiques pour l'évaluation des impacts d'activités aquacoles sur la palourde du Pacifique (Protothaca staminea)

PRRA-2009-P-08

Description

Souvent appelés des espèces clés, les bivalves constituent des éléments importants des écosystèmes côtiers et des écosystèmes estuariens. Ils jouent un rôle dominant dans le développement d'indices et de niveaux écosystémiques de santé, qui peuvent ensuite être appliqués aux écosystèmes en général. Le fait que des conditions environnementales stressantes (naturelles ou anthropiques) nuisent à la performance physiologique des animaux aquatiques (p. ex. croissance et fécondité), à leur santé et à leur survie est bien documenté. Au contraire des poissons, pour lesquels des épreuves biochimiques sensibles, des outils génomiques et des indicateurs visuels sont disponibles, il existe peu d'outils informatifs et fiables pour les bivalves. Dans le cadre de ce projet, nous allons développer des outils génomiques pour l'étude des réactions de la palourde du Pacifique à des facteurs anthropiques et environnementaux. Ces outils faciliteront l'utilisation de cette espèce comme bio-indicateurs dans l'évaluation de la santé et de la résilience d'écosystèmes en présence de stresseurs aquacoles et d'autres stresseurs possibles. En 2008 2009, nous avons reçu des fonds pour bâtir une banque d'ADNc pour la palourde du Pacifique. Les fonds pour 2009 2010 serviront au séquençage de l'étiquette de séquence exprimée dans le but d'identifier les gènes qui pourraient servir de bio-indicateurs de stress et/ou d'exposition à l'agent chimiothérapeutique SLICE® utilisé en aquaculture.

Nom du programme

Programme de recherche sur la réglementation de l'aquaculture (PRRA)

Année

2009 - 2010

Écorégion

Échelle nationale

Chercheur principal / Chercheurs principaux / Chercheuse principale / Chercheuses principales

Stewart Johnson
Courriel: Stewart.Johnson@dfo-mpo.gc.ca